Początkowo kurs organistowski odbywał się w domu parafialnym przy ul. Św. Idziego. W 1960 r. Ks. Leon Pęcherek, za zgodą Ks. Kardynała Bolesława Kominka przeniósł siedzibę Studium do budynku przy ul. Katedralnej 4, w którym mieści się ono do dnia dzisiejszego.